Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdsQ8VBT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SdsQ8VBT2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdsQ8VBT2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms