Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap47Q8R570 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap47Q8R570 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms