Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top1mtQ8R4U6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1mtQ8R4U6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms