Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy2Q8R4C2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy2Q8R4C2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms