Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms