Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2f4Q8R0K9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f4Q8R0K9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms