Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms