Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms