Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms