Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh3Q8K1E6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms