Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbrd1Q8K0B2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbrd1Q8K0B2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms