Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LgsnQ8CIX8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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