Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pramef8Q8CE24 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pramef8Q8CE24 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pramef8Q8CE24 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef8Q8CE24 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef8Q8CE24 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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