Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc38Q8CDN8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc38Q8CDN8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms