Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6030452D12RikQ8CD33 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms