Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc22Q8C5N3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc22Q8C5N3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms