Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp47Q8BY87 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Usp47Q8BY87 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp47Q8BY87 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms