Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmod1Q8BVA4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod1Q8BVA4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms