Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sv2bQ8BG39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sv2bQ8BG39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms