Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srgap3Q812A2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms