Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3cQ80U95 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms