Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usmg5Q78IK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms