Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms