Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Efr3bQ6ZQ18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efr3bQ6ZQ18 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms