Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm3bQ6ZPY7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm3bQ6ZPY7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm3bQ6ZPY7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm3bQ6ZPY7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms