Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms