Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf653Q6YND2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms