Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a1Q6X893 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms