Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc154Q6RUT8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc154Q6RUT8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc154Q6RUT8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc154Q6RUT8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc154Q6RUT8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc154Q6RUT8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms