Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc82Q6PG04 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms