Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb39Q6PDK0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms