Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam222bQ6P539 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms