Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2aQ6P4T0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms