Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdac10Q6P3E7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdac10Q6P3E7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms