Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms