Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab6Q6P1E8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Efcab6Q6P1E8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efcab6Q6P1E8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms