Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Pprc1Q6NZN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pprc1Q6NZN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms