Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf6Q6NVF9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpsf6Q6NVF9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpsf6Q6NVF9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms