Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms