Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KdsrQ6GV12 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KdsrQ6GV12 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KdsrQ6GV12 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KdsrQ6GV12 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KdsrQ6GV12 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KdsrQ6GV12 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms