Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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