Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms