Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt6hQ62383 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms