Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SypQ62277 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SypQ62277 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SypQ62277 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SypQ62277 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SypQ62277 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms