Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms