Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim27Q62158 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms