Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prg2Q61878 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg2Q61878 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms