Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms