Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsx2Q61412 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms