Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms